Историјски анатомски препарати из касних 1700-их у Музеју анатомије Хунтериан
Музеј анатомије © Тхе Хунтериан, Универзитет у Глазгову
Вирус прехладе који је заразио жену у Лондону пре око 250 година идентификован је генетском анализом, што га чини најстаријим потврђеним људским РНК вирусом.
Секвенцирање ДНК омогућило је научницима да пронађу трагове неких вируса старих и до 50.000 година из древних људских скелета. Али многи вируси, укључујући риновирусе који изазивају прехладе, имају геном направљен од РНК, која је много мање стабилна од ДНК и обично се разграђује у року од неколико сати након смрти.
Наше ћелије такође производе РНК као део процеса читања генетског кода и његовог превођења у протеине.
Последњих година, научници су померали старост у којој су могли да поврате древну РНК, а један тим је недавно извукао РНК из вунастог мамута који је угинуо пре 40.000 година.
„До сада су се већина древних РНК студија ослањала на изузетно добро очуване материјале, као што су узорци пермафроста или исушено семе, што у великој мери ограничава оно што можемо да научимо о прошлим људским болестима“, каже Ерин Барнетт у Центру за рак Фред Хачинсон у Сијетлу, Вашингтон.
Од раних 1900-их, многа ткива у колекцијама патологије су сачувана у формалину, који штити РНК од потпуне и брзе деградације. Барнет и њене колеге одлучиле су да потраже у збиркама патологија широм Европе људске узорке старије од ове који су можда били довољно добро очувани да би РНК преживела.
У Музеју анатомије Хунтериан на Универзитету у Глазгову, Велика Британија, тим је пронашао узорке плућног ткива, сачуване у алкохолу, а не у формалину, од две особе – жене из Лондона која је умрла око 1770-их и друге особе чији је пол непознат, а која је умрла 1877. Обе су имале документоване доказе о тешкој респираторној болести.
Научници су затим почели да изолују и РНК и ДНК из плућног ткива обе особе. Барнет каже да је РНК добијена из оба плућа била „екстремно фрагментирана“, при чему је већина делова у просеку дугачка само око 20 до 30 нуклеотида.
„Да то ставимо у перспективу, молекули РНК у живим ћелијама обично имају више од 1000 нуклеотида“, каже она. „Дакле, уместо да радимо са дугим, нетакнутим праменовима, састављали смо информације из многих ситних фрагмената.
Полако, међутим, истраживачи су успели да реконструишу цео РНК геном риновируса жене из 18. века. Пронашли су и доказе да јој је нанета бактерија која изазива респираторна обољења, као нпр Стрептоцоццус пнеумониае, Хаемопхилус инфлуензае и Моракелла цатаррхалис.
Затим су упоредили стари РНК вирус који су реконструисали са базом података у Националном институту за здравље САД која садржи записе о милионима вирусних генома, укључујући многе риновирусе прикупљене из целог света.
Ово је показало да историјски геном вируса спада у групу хуманог риновируса А и представља изумрлу лозу која је најближе повезана са модерним генотипом познатим као А19. „Упоређујући га са данашњим вирусима, процењујемо да су овај историјски вирус и савремени А19 последњи пут имали заједничког претка негде у 1600-им,“ каже Барнет.
„Приче ове две особе су углавном непознате и надамо се да ће ова студија помоћи да их препознамо“, каже она.
„То представља заиста важно откриће јер показује могућност опоравка РНК из влажних колекција које су претходиле употреби формалина“, каже Лове Дален на Универзитету у Стокхолму у Шведској.
„Ово је прва фаза у ономе што ће постати експлозија у проучавању РНК вируса. Многи РНК вируси брзо еволуирају, што значи да ће њихово проучавање у временским оквирима од неколико стотина година дати веома важан увид у еволуцију вируса“, каже он.
Теме:
