Алат АИ укључује предвиђања о томе како протеини ступају у интеракцију са потенцијалним терапеутским молекулима.Кредит: Исоморпхиц Лабс
Скоро две године након што је Гоогле ДеепМинд објавио ажурирани АлпхаФолд3 усмерен на откривање лекова, његов спин-офф за биофармацеутике, Исоморпхиц Лабс, најавио је још моћнији модел вештачке интелигенције – и све то држе за себе.
Исоморпхиц Лабс, са седиштем у Лондону, на 27 страница је рекламирао капацитете свог „машина за откривање лекова“ — који назива ИсоДДЕ технички извештај, објављен 10. фебруара. Достигнућа, укључујући прецизна предвиђања о томе како протеини ступају у интеракцију са потенцијалним лековима и структурама антитела, импресионирала су научнике који раде на том пољу.
Ипак, за разлику од АлпхаФолд АИ система за предвиђање структуре протеина – који су доступни другим истраживачима и детаљно описани у чланцима из часописа1,2 — ИсоДДЕ је власнички, а технички документ нуди оскудан увид у то како постићи сличне резултате.
АлпхаФолд има пет година — ови графикони показују како је револуционирао науку
„То је велики напредак, на скали АлпхаФолд4,“ мислећи на необјављену будућу генерацију Гоогле ДеепМинд технологије, каже Мохаммед АлКураисхи, рачунарски биолог са Универзитета Колумбија у Њујорку који ради на развоју потпуно отворених верзија АлпхаФолд-а. „Проблем је, наравно, што не знамо ништа о детаљима.“
Интеракције лек-протеин
АлпхаФолд 3 је развијен имајући на уму откриће лекова. За разлику од свог претходника АлпхаФолд2 који је освојио Нобле награду, модел би могао да предвиди структуре протеина у интеракцији са другим молекулима – укључујући потенцијалне лекове.
Слични АИ по узору на АлпхаФолд 3 су се приближили у потпуности својим перформансама и имају нове могућности. Модел отвореног кода под називом Болтз-2, који су развили научници са Масачусетског технолошког института у Кембриџу и објављен прошле године3може предвидети снагу до које потенцијални лекови нападају протеине, или афинитет везивања. Ово је кључна особина за развој терапеутике и обично се предвиђа помоћу рачунарски интензивних метода заснованих на физици.
АлпхаФолд-у понестаје података — па фармацеутске компаније праве сопствену верзију
Према извештају Исоморпхиц-а, његов нови АИ надмашује и Болтз-2 и методе засноване на физици у одређивању афинитета везивања. Предвиђања о томе како антитела – која чине основу за терапије које годишње остварују десетине милијарди фунти у продаји – ступају у интеракцију са својим циљевима су такође најсавременија, тврди се у извештају.
АлКураисхи каже да је посебно импресиониран способношћу ИсоДДЕ-а да предвиди интеракције молекула између лекова и протеина које се знатно разликују од података на којима је модел обучен. „То је заиста тежак проблем и сугерише да су они сигурно урадили нешто прилично ново“, каже он.
